Нейросетевой пакет глубокого обучения, основанный на обработке данных первопринципных расчетов (VASP, Quantum Espresso,…), для построения модели межатомной потенциальной энергии и силового поля, а также для выполнения молекулярной динамики (МД). DeePMD может быть легко интегрирован со стандартным программным обеспечением классической молекулярной динамики (LAMMPS, OpenMM, GROMACS и т. д.). DeePMD-kit позволяет повысить скорость расчета молекулярной динамики на несколько порядков по сравнению с квантовой молекулярной динамикой, при этом сохраняя точность ab initio расчетов. DeePMD может применяться, как для описания отдельных молекул, так и для кристаллов и неупорядоченных систем.
Для использования пакета необходимо, осуществив вход на mvs10q.jscc.ru, выполнить следующие команды (строго в приведенной последовательности):
source /home2/vasp/SOFT_intel_21/DeepMD/DeepMD_latest/bin/activate
conda activate root
После этого будет активированы виртуальная среда anaconda python3, в которой установлен deepmd и lammps с поддержкой нейросетевых потенциалов deepmd. Пример запуска DeepMD можно найти в /home2/vasp/SOFT_intel_21/DeepMD/Examples.
Инструкция по запуску примеров /home2/vasp/SOFT_intel_21/DeepMD/Examples/README